Die Struktur des BAZL unterscheidet klar zwischen Aktivitäten, welche die Sicherheit der Zivilluftfahrt betreffen und den Aktivitäten, welche die Luftfahrtpolitik betreffen. Diese Struktur erlaubt es dem BAZL zukunftsgerichtet und effektiv die Aufgaben als Zertifizierungs- und Aufsichtsbehörde wahrzunehmen und seine Funktion als Regulierungsbehörde im nationalen und internationalen Rahmen auszuüben. Weiter nimmt das BAZL eine zentrale Rolle bei der Entwicklung der schweizerischen Luftfahrtpolitik ein.